无痛人流也存在一定危险性，比如术中可能出现子宫穿孔，发生率约为0.5%左右；还有可能出现麻醉相关风险，像麻醉药物过敏，虽然发生概率较低，但一旦发生可能危及生命；术后还可能有宫腔粘连的风险，据统计，人工流产术后宫腔粘连的发生率在10%~15%左右。
术中可能出现的风险
子宫穿孔： 这是比较严重的术中风险，多发生在子宫位置过度倾屈、哺乳期子宫等情况。医生操作时如果用力不当，就可能导致子宫肌层全层或部分裂开，引发穿孔。出血： 手术过程中如果胚胎组织清除不彻底，或者子宫收缩不良，都可能导致出血。一般出血量如果超过200毫升就属于人工流产出血过多的情况。
麻醉相关风险
麻醉药物过敏： 虽然现在会在术前进行过敏试验等筛查，但仍有极小概率出现对麻醉药物过敏的情况。过敏可能表现为皮疹、呼吸困难、血压下降等，严重时会危及生命。呼吸抑制： 麻醉药物可能会抑制呼吸中枢，导致呼吸频率减慢、呼吸幅度减小等情况。不过现在有先进的麻醉监测设备，医生会及时发现并处理。
术后可能出现的问题
宫腔粘连： 人工流产手术会对子宫内膜造成损伤，尤其是多次人流的女性，子宫内膜受损严重，就容易导致宫腔粘连。宫腔粘连会引起月经异常，如月经量减少、闭经等，还可能影响以后的受孕，导致不孕或者反复流产等情况。感染： 术后如果不注意个人卫生，或者过早性生活等，容易引发感染。感染可累及子宫内膜、输卵管等部位，引起盆腔炎等疾病，出现腹痛、发热、阴道分泌物异常等症状。