要根治毛囊炎，需要根据具体病因选择合适的药物。以下是一些可能有效的治疗药物：
1.外用抗生素：如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等，对于细菌感染引起的毛囊炎有较好的疗效。
2.抗真菌药物：如果毛囊炎是由真菌感染引起的，如马拉色菌毛囊炎，则需要使用抗真菌药物，如酮康唑乳膏、克霉唑乳膏等。
3.角质促成剂：有助于改善毛囊角化，减少皮脂分泌，如5%硫磺霜、3%水杨酸酊等。
4.系统抗生素：对于严重的毛囊炎或反复发作的患者，可能需要口服抗生素进行治疗。常用的抗生素有阿莫西林、头孢呋辛酯等。
5.维A酸类药物：可调节毛囊角质形成细胞的分化，减少皮脂分泌，对痤疮丙酸杆菌有抑制作用，如维A酸乳膏、异维A酸胶囊等。
6.其他药物：对于某些特殊类型的毛囊炎，如穿掘性毛囊炎，可能需要使用免疫调节剂、糖皮质激素等药物进行治疗。
需要注意的是，使用药物治疗毛囊炎时，应遵循医生的建议，按照正确的用法用量使用。同时，保持皮肤清洁，避免搔抓和挤压患处，注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物，有助于病情的恢复。
此外，对于某些特殊人群，如孕妇、哺乳期妇女、儿童等，使用药物需要特别谨慎，应在医生的指导下使用。如果毛囊炎症状严重或持续不愈，应及时就医，以便进行进一步的诊断和治疗。
总之，根治毛囊炎需要综合考虑病因、病情严重程度以及个体差异等因素，选择合适的药物进行治疗。同时，注意皮肤护理和生活习惯的调整，有助于提高治疗效果和预防复发。