腰穿是神经内科常用的临床操作，取中枢神经系统的脑脊液做化验，判断中枢神经系统患了哪些疾病。新生儿腰穿，只要执行严格的腰穿操作流程，进行无菌操作，不反复多次腰穿，不大量放脑脊液，就不会对日后的成长产生任何影响。
如果新生儿反复腰穿，可能会导致长期的脑脊液压力低，容易引起头痛、患儿哭闹不休、引起黏连性的蛛网膜炎、导致患者出现手脚麻木或骶尾部麻木的症状。
如果黏连严重，还有可能会导致脑脊液循环障碍，引起梗阻上方的脑脊液压力升高，下方压力减低。出现这种情况，对生长发育没有太大影响，但可能会有肢体无力或麻木的症状。