脑垂体囊肿根据垂体囊肿的大小和引起的症状选择治疗的方法，如果脑垂体的囊肿很小，患者没有特殊的临床表现，比如头痛、视力障碍或者内分泌的变化，患者也没有皮肤颜色的改变，可以暂时观察，不用特殊处理，半年或者一年复查一次垂体的磁共振片，以了解囊肿有没有增大。
如果垂体的囊肿增大并出现压迫症状，比如压迫视交叉而出现视力改变、视物不清。囊肿引起的内分泌激素变化，比如引起月经稀少、女性出现闭经或者男性出现性功能障碍，还有的患者出现乳房发育或者尿崩症、甲状腺激素变化，要考虑进行手术治疗，所以脑垂体的囊肿应该根据囊肿大小和引起的症状决定治疗的方法。