包皮上有小疙瘩可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因和建议：
1.珍珠状阴茎丘疹：这是一种常见的良性病症，表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现的珍珠状、半透明丘疹，可能与生理发育变异、局部刺激等因素有关。通常不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光治疗、冷冻治疗等方式去除。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状。通常采用物理治疗、药物治疗、免疫疗法等综合治疗。
3.包皮龟头炎：可由感染、局部刺激等因素引起。表现为包皮红肿、灼痛、排尿时加重、可有脓性分泌物自包皮口流出。翻开包皮可见包皮内板和阴茎头充血、肿胀、重者可有浅小溃疡或糜烂，表现有小疙瘩。治疗以局部治疗为主，感染明显时，全身应用抗生素。
4.其他：包括皮脂腺异位症、传染性软疣、鲍温样丘疹病等。
如果发现包皮上有小疙瘩，建议及时就医，明确诊断，并根据具体情况采取相应的治疗措施。同时，注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓和摩擦，避免不洁性行为。