新生儿打防疫针后化脓，可能是正常的免疫反应，也可能是感染引起。以下是一些可能的原因和处理方法：
1.正常的免疫反应：部分疫苗接种后，可能会出现局部红肿、化脓等反应，这是身体对疫苗的正常免疫反应。通常不需要特殊处理，保持局部清洁干燥即可。但如果化脓严重，或者出现发热、哭闹等不适，应及时就医。
2.感染：如果接种部位护理不当，如沾水、摩擦等，可能会导致感染，引起化脓。此时需要及时就医，医生可能会进行局部处理，如清创、消毒等，并使用抗生素治疗。
3.其他：如果新生儿本身有免疫缺陷疾病，或者接种的疫苗质量有问题，也可能导致化脓等不良反应。这种情况比较少见，如果怀疑是疫苗质量问题，应及时向相关部门报告。
需要注意的是，每个新生儿的情况都可能不同，如果对新生儿打防疫针后化脓的情况有任何疑问，最好咨询医生的意见。同时，家长应注意保持新生儿接种部位的清洁干燥，避免搔抓和摩擦，避免让新生儿接触感染源。如果出现异常情况，应及时就医。