月经期间头痛约30%的女性会出现，其原因主要有以下几方面。
激素变化因素
雌激素波动： 在月经期间，女性体内雌激素水平会发生明显波动。月经前雌激素水平逐渐升高，月经来潮时雌激素水平急剧下降。这种雌激素的变化可能会影响血管的张力，导致颅内血管舒缩功能紊乱，从而引发头痛。一般在月经前2 - 3天开始出现相关变化，进而可能引发头痛。前列腺素影响： 月经期间子宫内膜会合成并释放较多前列腺素。前列腺素除了会引起子宫收缩外，还可能作用于血管，使脑血管扩张，进而导致头痛。而且前列腺素还可能影响神经递质的释放，进一步加重头痛症状。
神经递质因素
5 - 羟色胺变化： 5 - 羟色胺是一种与情绪和头痛相关的神经递质。月经期间体内5 - 羟色胺的代谢会发生改变，其水平的波动可能会影响神经系统的功能，导致头痛发生。研究发现，月经期间女性体内5 - 羟色胺水平下降时，更容易出现头痛症状。内啡肽变化： 内啡肽具有镇痛等作用。月经期间内啡肽的分泌也会有所变化，内啡肽分泌减少时，对疼痛的调节作用减弱，从而增加头痛发生的可能性。
个体差异因素
遗传因素： 如果家族中有女性成员在月经期间容易出现头痛的情况，那么个体发生月经期间头痛的概率可能会增加。遗传因素可能会使个体的神经系统对月经期间体内激素等变化更加敏感，从而更容易引发头痛。生活方式因素： 长期睡眠不足、精神压力大的女性在月经期间更容易出现头痛。例如，经常熬夜的女性，月经期间身体的调节能力下降，头痛发生的风险会升高。另外，饮食方面，过多摄入咖啡因的女性，月经期间咖啡因的刺激可能会加重头痛症状，因为咖啡因会导致血管收缩，而月经期间血管本就处于不稳定状态。