儿童肚子疼的原因有多种。比如消化不良较为常见，多因儿童饮食不规律，一次进食过多或吃了不易消化的食物，约有30% - 40%的儿童肚子疼是由消化不良引起的。
一、消化系统问题
1. 胃肠痉挛： 儿童的胃肠功能还未发育完善，受到寒冷刺激、进食过快等情况，容易引发胃肠痉挛导致肚子疼。一般疼痛呈阵发性，可能持续几分钟到十几分钟不等。比如孩子腹部着凉后，就可能出现这种情况。2. 肠道寄生虫感染： 像蛔虫、蛲虫等肠道寄生虫感染也会导致肚子疼。其中蛔虫感染较为常见，孩子可能会出现脐周隐痛等情况，尤其在夜间可能会因虫子活动而使疼痛加重。
二、外科性疾病
1. 急性阑尾炎： 儿童也可能患上急性阑尾炎，表现为开始时脐周疼痛，数小时后转移至右下腹疼痛，还可能伴有发热、恶心、呕吐等症状。一般这种疼痛是比较持续且逐渐加重的。2. 肠套叠： 多发生于2岁以下的儿童，典型表现为突发的剧烈腹痛，孩子会哭闹不安，还可能伴有呕吐、果酱样大便等症状。这种情况需要及时就医处理，否则可能会导致肠道坏死等严重后果。
三、其他系统问题
1. 呼吸道感染累及腹部： 有些上呼吸道感染的儿童，也可能出现肚子疼的情况，这是因为感染累及到了腹部的神经等，可能同时伴有咳嗽、流涕等呼吸道感染的症状。2. 过敏性紫癜： 部分儿童患过敏性紫癜时也会出现肚子疼，同时可能伴有皮肤紫癜、关节疼痛等表现，这种肚子疼往往是比较剧烈的，且可能与皮肤紫癜出现的时间有一定关联。