肛门痛的原因可能有以下几点：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。肛门检查时可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.外痔：肛缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，大便时可变大，一般无触痛，合并感染或形成血栓时则有肿胀、疼痛。
3.内痔：发生在肛管齿状线以上，无肛管皮肤所覆盖由粘膜下痔内静脉丛扩大曲张所形成柔软的静脉团，排便时内痔脱出肛门外，排便后自行回纳，伴有便血，血色鲜红。
4.肛周脓肿：是指肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。其主要症状是肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安，全身感染症状不明显。
5.肛管直肠恶性肿瘤：肛管直肠癌破溃感染，多伴有脓性分泌物，伴有恶臭，肛门部坠胀，疼痛，消瘦，排便习惯改变等症状。
6.肛门异物损伤：多为外伤异物残留或饮食不当，鱼刺、骨片嵌插肛管直肠所致，故需请医生仔细检查，取出异物，疼痛即能缓解。若滞留时间过长，可引起局部感染。