40天未见卵黄囊和胚芽，可能是以下原因导致：
1.受孕时间较短：受精卵着床时间较晚，实际怀孕时间并未达到40天，孕囊和胎芽还没有形成。这种情况下，可以过一周后复查B超，以明确诊断。
2.胚胎发育不良：如果孕囊的形状不规则、干瘪，或者没有胎心胎芽，可能提示胚胎发育异常。这可能是由于染色体异常、内分泌失调、子宫环境不良等原因引起的。需要进一步进行孕酮、HCG等检查，并结合医生的建议进行处理。
3.月经不规律：女性的月经周期不规律，排卵时间不确定，受孕时间较晚，也会导致停经40天看不到卵黄囊和胚芽。
4.其他因素：如果孕妇有子宫肌瘤、子宫畸形等情况，也可能影响孕囊的发育。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体情况需要结合个人的具体情况和医生的进一步检查来确定。如果对检查结果有疑虑或担忧，建议及时咨询医生，以便获得更专业的建议和指导。