阴天下雨腰疼可能与多种因素有关。比如，有研究发现约60% - 70%的腰部患有疾病的人对天气变化比较敏感，阴天下雨时容易出现腰疼症状。
腰部本身的病变因素
腰肌劳损：长期从事重体力劳动、久坐久站等人群易患腰肌劳损。阴天下雨时，气温降低、湿度增加，会使腰部肌肉、筋膜等组织的血液循环减慢，代谢产物堆积，从而诱发或加重腰疼。患者腰部有长期酸痛不适感，劳累后加重，休息后可缓解。腰椎间盘突出症：腰椎间盘的退变、损伤等因素可导致椎间盘突出，压迫神经根。阴天下雨时，腰椎周围的肌肉、韧带等组织受到寒冷、潮湿刺激，会出现痉挛，进一步加重对神经根的压迫，引发腰疼。一般还伴有下肢放射性疼痛、麻木等症状。
风湿免疫性因素
强直性脊柱炎：这是一种慢性炎症性疾病，主要侵犯骶髂关节、脊柱等部位。阴天下雨时，病情容易活动，导致腰部疼痛、僵硬，早晨起床时症状往往比较明显，活动后可稍有缓解，但长时间不活动又会加重。多见于青壮年男性，有家族遗传倾向。类风湿关节炎：虽然主要累及小关节，但也可能影响腰部。阴天下雨时，关节局部血液循环不畅，炎症反应加剧，引起腰部疼痛，同时可能伴有关节肿胀、晨僵等表现。
慢性肾脏疾病因素
慢性肾盂肾炎：肾脏周围的组织受到炎症刺激，阴天下雨时，身体抵抗力可能相对下降，炎症容易复发或加重，导致腰部隐隐作痛。患者还可能伴有尿频、尿急、尿痛等泌尿系统症状。肾小球肾炎：部分肾小球肾炎患者也可能出现腰部酸痛，阴天下雨时症状可能更明显。同时可能有蛋白尿、水肿、高血压等表现。