口腔扁平苔藓的治疗目前没有绝对意义上的特效药，需根据不同情况进行个体化治疗。
局部病损较轻情况
若局部病损较轻，可使用糖皮质激素局部涂布，如曲安奈德口腔软膏等，能减轻炎症反应。对于有糜烂的情况，可使用氯己定含漱液，起到抗菌消炎的作用，促进糜烂面愈合。
全身症状明显情况
当患者全身症状明显时，可能需要使用免疫抑制剂，如硫唑嘌呤等，但需密切监测药物不良反应。同时，还可配合使用中药辅助治疗，一些中药方剂具有调节机体免疫等作用，但需在专业中医师指导下使用。
伴发其他疾病情况
如果口腔扁平苔藓伴发其他全身性疾病，如糖尿病等，要首先积极控制基础疾病。因为基础疾病的控制对口腔扁平苔藓的恢复也有重要影响，例如良好控制糖尿病血糖水平，可能利于口腔扁平苔藓病损的改善。
特殊人群情况
对于儿童患者，由于其身体处于发育阶段，在治疗时更倾向于选择相对温和的局部治疗方法，尽量避免使用不良反应较大的全身用药。而老年患者可能合并多种基础疾病，在选择治疗药物时需充分考虑药物相互作用等因素，谨慎用药。女性患者在月经周期等特殊时期，免疫状态可能会有变化，病情可能会有一定波动，治疗过程中需关注这一情况，适当调整治疗方案。