胃镜和肠镜都是消化系统常用的检查方法，但它们有很多区别。胃镜检查通常是将一根带有摄像头的管子从口腔插入，经过食管、胃到达十二指肠，能直接观察上消化道的情况，一般检查时间在5~10分钟左右，价格大概在200~800元不等。而肠镜是从肛门插入，经直肠、结肠到达回盲部，观察肠道情况，检查时间相对长一些，大概10~30分钟，价格在300~1000元左右。
检查部位：
胃镜检查部位：主要针对食管、胃和十二指肠球部。比如能清晰看到食管有没有炎症、溃疡、肿瘤等病变，胃内的情况，像胃炎、胃溃疡、胃息肉等，还有十二指肠球部的状况。肠镜检查部位：主要是对直肠、结肠进行检查。可以发现直肠炎、结肠炎、结肠息肉、结肠癌等肠道疾病。
检查前准备：
胃镜检查前准备：检查前8~12小时要禁食禁水，这样能让胃内排空，保证检查时视野清晰。还要口服去泡剂等药物，清除胃内的泡沫。肠镜检查前准备：检查前1~2天要吃少渣饮食，比如稀饭、面条等。检查前4~6小时要进行肠道清洁准备，通常需要喝大量的泻药，将肠道内的粪便排干净，保证肠道清洁，以便医生能清楚观察肠道黏膜。
检查感受：
胃镜检查感受：检查时可能会有恶心、咽部不适的感觉，因为管子要通过咽部进入食管，有些人会比较敏感，感觉不舒服，但一般都能耐受。肠镜检查感受：检查时可能会有腹胀、腹痛的感觉，尤其是在进镜通过弯曲部位时，不过现在也有无痛肠镜，就是在麻醉状态下进行检查，患者不会有明显不适。
适用情况：
胃镜适用情况：当出现上腹部疼痛、反酸、烧心、呕吐、吞咽困难等上消化道症状时，需要做胃镜检查。比如怀疑有胃溃疡、胃肿瘤等疾病时，胃镜是重要的检查手段。肠镜适用情况：当出现下腹部疼痛、腹泻、便秘、便血等肠道症状时，需要做肠镜检查。像怀疑有结肠癌、直肠息肉等肠道疾病时，肠镜检查能明确诊断。