小孩囟门闭合晚可能由以下原因引起：
1.维生素D缺乏性佝偻病：由于维生素D缺乏，导致钙磷代谢异常，引起骨骼发育异常。除囟门闭合晚外，还可能伴有方颅、鸡胸、O型腿或X型腿等症状。此时需要及时补充维生素D和钙剂，并多晒太阳。
2.脑积水：由于脑脊液循环障碍，导致颅内脑脊液增多，可出现囟门饱满、头颅增大、落日眼等症状。需要及时就医，进行头颅CT或MRI检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
3.甲状腺功能减退症：由于甲状腺激素分泌不足，导致代谢率降低，也会影响骨骼发育，出现囟门闭合延迟、出牙晚、身材矮小等症状。需要检测甲状腺功能，明确诊断后，补充甲状腺素进行治疗。
4.其他：一些遗传代谢性疾病、脑部疾病等也可能导致囟门闭合晚，如黏多糖病、苯丙酮尿症、小头畸形等。
如果发现小孩囟门闭合晚，建议及时带孩子到医院就诊，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长应注意给孩子提供均衡的营养，多晒太阳，促进钙的吸收。