生化妊娠不能说明输卵管通畅。
生化妊娠是指精卵结合了，一般精卵结合七天以后就要分泌绒毛膜促性腺激素，再过七天以后，用早孕试纸就可以测出来，往往精卵结合了，但是必须结合成受精卵，受精卵还要回到子宫里着床，生化妊娠就是结合了，但是没有回到子宫里着床，或者是回来了，没有着上床，这种叫生化妊娠。
原因一：受精卵本身有缺陷
一般认为胚胎染色体异常可能是导致生化妊娠的主要原因。怀孕前三个月早期自然流产中，有超过50%的流产原因是染色体异常。
原因二：卵巢黄体功能不好
黄体不好，导致黄体酮分泌不足，子宫内膜异常，影响受精卵在子宫内的着床。
原因三：子宫因素
子宫发育不良、子宫粘膜下肌瘤、子宫内膜息肉、宫腔粘连、子宫内膜结核等影响受精卵着床。
原因四：外界因素
女性在不知道怀孕的情况下吸烟（包括吸二手烟）、饮酒、接触化学毒物、严重的噪声和震动、情绪过度激动、高温环境等，可导致胎盘和胎儿损伤，造成流产。
原因五：免疫因素
近年来对免疫因素的研究，认为有两种免疫情况影响受孕。
同种免疫：精子、精浆或受精卵是抗原物质，被阴道及子宫上皮吸收后，通过免疫反应产生抗体物质，使精子与卵子不能结合或受精卵不能着床。
自身免疫：认为不孕妇女血清中存在透明带自身抗体，与透明带起反应后可防止精子穿透卵子，因而阻止受精。
综上所述，生化妊娠是一种自然流产，是指精卵结合后没有成功在子宫着床，因此不能说明输卵管通畅。如果多次发生生化妊娠，建议及时就医，进行全面的检查，以确定具体原因，并采取相应的治疗措施。