脊髓亚急性联合变性后遗症通常与维生素B12缺乏未及时纠正有关，若病情迁延，可能遗留不同程度的神经功能障碍。比如约有半数患者会遗留肢体无力等问题。
运动功能方面的后遗症表现
肢体无力： 患者可能出现双下肢无力的情况，严重时行走困难，甚至需要借助轮椅。这是因为脊髓后索和侧索受损影响了神经对肌肉的支配。步态异常： 部分患者会出现蹒跚步态，走路时像鸭子一样摇摇晃晃，这是由于脊髓病变导致运动协调性受影响。
感觉功能的后遗症情况
深感觉障碍： 患者会有肢体位置觉、振动觉减退或消失的现象，比如自己很难准确感知肢体处于什么位置，闭眼时无法辨别肢体的抖动等。痛温觉异常： 可能出现痛温觉减退，对疼痛和温度的感知不如正常人灵敏，容易在不经意间受到烫伤或刺伤等。
自主神经功能的后遗症影响
二便功能障碍： 部分患者会出现大小便失禁或潴留的情况，这是因为脊髓病变波及自主神经，影响了对膀胱和直肠的控制。皮肤营养改变： 由于神经功能受损，皮肤可能出现干燥、脱屑等营养障碍表现，长期不愈还可能引发皮肤溃疡等问题。
认知与精神方面的后遗症
记忆力减退： 少数患者可能存在记忆力下降的情况，对近期发生的事情容易遗忘。情绪改变： 有的患者会出现抑郁、焦虑等情绪问题，这与神经系统受损后神经递质平衡被打破有关。