阴道乳酸菌对维持阴道微生态平衡很重要，健康女性阴道内约有50多种微生物，其中乳酸菌占比能达到90%以上。
维持阴道酸性环境
抑制有害菌生长： 阴道乳酸菌能发酵糖类产生乳酸，使阴道pH值保持在3.8~4.4的酸性环境，这种酸性环境不利于有害菌如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等的生长繁殖。比如，当阴道内乳酸菌数量充足时，能有效抑制一些条件致病菌的过度增生。形成生物屏障： 乳酸菌可以在阴道黏膜表面形成一层生物膜，就像一道天然的屏障，阻止有害菌黏附在阴道上皮细胞上，从而保护阴道黏膜免受病原体的侵袭。
参与免疫调节
增强局部免疫： 阴道乳酸菌能够刺激阴道局部的免疫细胞活性，比如可以促进阴道黏膜相关淋巴组织中免疫球蛋白A（IgA）的分泌，IgA能阻止病原体与阴道上皮细胞结合，增强阴道的局部免疫防御功能。调节细胞因子： 乳酸菌可以调节阴道局部细胞因子的分泌，细胞因子在免疫反应中起着重要的调节作用，合适的细胞因子水平有助于维持阴道内环境的稳定，抵御外来病原体的入侵。
维护阴道正常功能
保持阴道自洁： 正常的阴道乳酸菌群落有助于维持阴道的自净作用，通过产生乳酸等物质，不断清除阴道内的脱落细胞、病原体等异物，使阴道保持相对清洁的状态。例如，每天阴道内会有一定的代谢产物和可能进入的少量病原体，乳酸菌能及时将这些物质处理掉。保障上皮细胞健康： 阴道乳酸菌产生的一些代谢产物可以促进阴道上皮细胞的正常增殖和分化，维持阴道上皮细胞的完整性，使阴道上皮细胞能够更好地发挥其屏障功能，防止外界有害物质轻易进入阴道深层组织。