在安全期内进行性行为但仍怀孕的原因可能有以下几点：
1.排卵提前或推迟：女性的排卵时间可能会因情绪、压力、环境等因素而发生变化，即使在安全期，也有可能提前或推迟排卵，导致受孕。
2.安全期计算不准确：安全期的计算方法并不完全准确，因为女性的月经周期可能会受到多种因素的影响而发生变化。此外，精子在女性体内可能会存活数天，增加了受孕的机会。
3.额外的排卵：有些女性可能会有额外的排卵，这种情况在安全期进行性行为时也可能导致怀孕。
4.避孕方法失败：即使使用了避孕措施，如避孕套破裂、避孕药失效等，也可能导致怀孕。
需要注意的是，安全期并不是绝对安全的避孕方法，其失败率较高。为了避免意外怀孕，建议采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药、宫内节育器等。此外，还应该注意避孕方法的正确使用和注意事项，以提高避孕的效果。如果对安全期避孕方法存在疑虑或有怀孕的担忧，建议咨询医生或专业的避孕顾问，以获取更准确和个性化的建议。同时，如果出现月经推迟或其他怀孕症状，应及时进行验孕以确认是否怀孕。