肺动脉高压是一种比较复杂的疾病，其病因有多种情况。据相关研究，肺动脉高压的病因大致可分为以下几类。
一、遗传性因素
遗传突变相关： 约15%的特发性肺动脉高压患者存在骨形成蛋白受体2（BMPR2）等基因的突变。这些遗传突变会影响血管的正常调节功能，使得血管收缩、重构等出现异常，从而增加肺动脉高压的发病风险。比如家族中若有一人患有与遗传相关的肺动脉高压，其他家族成员患病的概率会相对升高，但具体的遗传传递方式较为复杂。
二、疾病相关性因素
（一）先天性心脏病相关
左向右分流型先心病： 像房间隔缺损、室间隔缺损等左向右分流型先天性心脏病，如果长期不治疗，会使肺循环血流量持续增加，肺血管长期处于高压状态，逐渐引起肺血管重构，进而发展为肺动脉高压。据统计，约有20%的房间隔缺损患者可能会进展为肺动脉高压。
（二）结缔组织病相关
系统性红斑狼疮等： 系统性红斑狼疮、硬皮病等结缔组织病也可引发肺动脉高压。这些自身免疫性疾病会导致机体产生异常的免疫反应，免疫复合物沉积在肺血管等部位，引起血管炎症和损伤，最终导致肺动脉高压。例如系统性红斑狼疮患者中，约有10% - 15%会并发肺动脉高压。
三、药物及毒物相关性因素
某些药物： 一些食欲抑制剂，如芬氟拉明等，在长期使用后可能会增加肺动脉高压的发病风险。还有某些减肥药中含有的成分也可能与肺动脉高压的发生有关。另外，长期接触某些毒物，如甲苯二异氰酸酯等，也可能损伤肺血管内皮细胞，影响肺血管的正常功能，进而引发肺动脉高压。
四、其他因素
门静脉高压相关： 患有门静脉高压的患者，也有一定概率并发肺动脉高压。其具体机制可能与门静脉高压导致的体循环和肺循环之间的血流动力学改变以及血管活性物质失衡等有关。此外，一些血液系统疾病，如慢性溶血性贫血等，也可能通过多种途径影响肺血管，从而增加肺动脉高压的发生几率。