两三个月不来月经可能由多种原因引起。首先，怀孕是常见原因之一，如果有性生活且未采取避孕措施，女性可以用验孕棒检测晨尿，初步判断是否怀孕，若想更准确，可去医院做血HCG检查。
一、内分泌失调因素
1. 多囊卵巢综合征： 这是常见的导致月经紊乱的原因。体内激素失衡，雄激素水平偏高，会影响卵巢正常排卵，进而出现两三个月不来月经的情况。患者往往还伴有多毛、痤疮等表现。一般通过检查性激素六项以及B超来辅助诊断。2. 甲状腺功能异常： 甲状腺分泌的激素对月经周期有调节作用。甲状腺功能减退时，身体代谢减缓，可能影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致月经推迟，甚至两三个月不来。通过检测甲状腺功能指标可明确。
二、生活方式因素
1. 过度减肥： 有些女性为了瘦身过度节食，摄入热量过低，身体缺乏足够营养来维持正常的生理功能，包括激素的正常分泌，从而影响月经周期，出现两三个月不来月经的状况。一般体重下降明显，低于正常范围时容易发生。2. 长期熬夜： 长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响内分泌系统的正常节律，导致激素分泌紊乱，进而干扰月经周期，使月经推迟，甚至长时间不来。经常熬夜的人更易出现这种情况。
三、疾病因素
1. 子宫内膜结核： 结核杆菌感染子宫内膜，会破坏子宫内膜的正常功能，影响月经的正常来潮，可能出现两三个月不来月经的现象。同时可能伴有低热、盗汗等结核中毒症状。通过子宫内膜活检等检查可确诊。2. 卵巢早衰： 女性在40岁以前卵巢功能衰退，雌激素分泌减少，会导致月经稀发甚至闭经，出现两三个月不来月经的情况。激素检查显示促性腺激素升高，雌激素降低。