排尿时尿道刺痛通常是由多种原因引起的，比如泌尿系统感染，像尿道炎，约有 90%的尿道炎是由细菌感染导致的。
一、泌尿系统感染
膀胱炎： 除了尿道刺痛，还可能伴有尿频、尿急，严重时会出现血尿。女性由于尿道短而直，更容易患上膀胱炎，大约有 30%的女性在一生中会至少患一次膀胱炎。尿道炎： 分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎。淋菌性尿道炎主要是由淋病奈瑟菌感染引起，非淋菌性尿道炎多由衣原体、支原体感染所致。患者除了尿道刺痛，还会有尿道分泌物增多的情况。
二、尿道结石
结石刺激： 尿道内的结石会损伤尿道黏膜，从而引起尿道刺痛。结石如果比较小，可能会随着尿液排出，但在排出过程中会导致尿道刺痛明显。而且结石长期存在还可能引起尿道感染等并发症。
三、性传播疾病
尖锐湿疣： 由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，病变多发生在尿道外口等部位，会导致尿道出现异物感、刺痛等不适症状，并且局部可能会有赘生物生长。生殖器疱疹： 由单纯疱疹病毒感染引起，发病时尿道周围会出现水疱，破裂后形成溃疡，引起尿道刺痛，同时伴有局部的疼痛、瘙痒等症状，而且容易反复发作。