甲钴胺长期服用可能会产生一些危害，因此应在医生的指导下谨慎使用。
甲钴胺是一种内源性的辅酶B₁₂，存在于血液、髓液中，与维生素B₁₂相比，其对神经元的传导有良好的改善作用，可通过甲基转换反应促进核酸-蛋白-脂肪代谢，其作为甲硫氨酸合成酶的辅酶，可使高半胱氨酸转化为甲硫氨酸，参与脱氧核苷合成胸腺嘧啶的过程，促进核酸、蛋白质的合成，具有营养神经的作用。
甲钴胺在治疗周围神经病方面有较好的疗效，如糖尿病性周围神经病、特发性面神经麻痹、三叉神经痛等，也可用于因缺乏维生素B₁₂引起的巨幼细胞性贫血。
甲钴胺通常耐受性良好，不良反应较少，但长期大量服用可能会引起一些不良反应，如食欲不振、恶心、呕吐、腹泻等，偶见过敏反应，如皮疹。此外，甲钴胺可能会影响测定值，如需进行日立7080全自动生化分析仪检测者，应在注射甲钴胺注射液至少6小时后采血，以免干扰检测结果。
需要注意的是，对甲钴胺或处方中任何辅料有过敏史的患者禁用。从事汞及其化合物的工作人员，不宜长期大量服用甲钴胺，因为甲钴胺可能会促进甲基汞的排泄。由于甲钴胺主要通过肾脏排泄，所以肾功能损害患者应适当调整剂量。
总之，甲钴胺是一种营养神经的药物，虽然安全性较高，但长期大量服用仍可能会对身体造成一定的影响。在使用甲钴胺时，应严格按照医生的建议剂量和使用方法进行服用，避免自行增减剂量。同时，应注意观察身体反应，如有不适及时就医。