龟头下边有肉芽可能是尖锐湿疣、珍珠状阴茎丘疹、龟头炎等原因所致，可以通过药物、手术、物理治疗等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.尖锐湿疣：人乳头瘤病毒（HPV）感染龟头、冠状沟等部位，可引起菜花状、鸡冠状的赘生物，常伴有瘙痒、疼痛、性交不适等症状。主要通过性接触传播，也可通过间接接触患者的污染物而感染。治疗方法包括外用药物（如咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等）、物理治疗（如激光、冷冻、电灼等）和手术治疗（如疣体切除术等）。
2.珍珠状阴茎丘疹：常见于青春期后，表现为龟头冠状沟边缘的珍珠状半透明丘疹，可环绕龟头分布，无明显自觉症状。病因可能与生理发育变异、包皮过长、局部刺激等有关。一般不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光、冷冻等物理方法去除丘疹。
3.龟头炎：可由感染、外伤、刺激等因素引起，表现为龟头红斑、丘疹、水疱等，可伴有疼痛、瘙痒、异味等症状。治疗方法根据病因和病情而定，如感染引起者可外用抗生素软膏（如红霉素软膏、莫匹罗星软膏等），过敏性因素所致者可外用糖皮质激素软膏（如糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等），包皮过长或包茎者可行包皮环切术。
患者在治疗期间需要注意局部清洁卫生，避免搔抓、摩擦疣体，治疗期间应避免性生活，以防交叉感染。同时，应避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒、大蒜等。