月经停了两天后同房是否会怀孕，需要根据具体情况进行分析，以下是一些可能的情况：
1.怀孕的可能性较小：一般来说，月经结束后的前两天是安全期，此时卵巢通常不会排卵，因此怀孕的几率较低。但需要注意的是，安全期并不是绝对的安全，因为女性的排卵时间可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而发生变化。
2.额外排卵：极少数情况下，女性可能会在月经周期中出现额外的排卵，即使月经已经停止两天，仍然有可能怀孕。
3.月经不规律：如果女性的月经周期不规律，排卵时间也会难以预测，从而增加怀孕的风险。
4.其他因素：精子在女性体内可能会存活数天，因此即使月经已经停止两天，仍然有可能在后续的同房中受孕。
需要注意的是，以上只是一些常见的情况，每个人的身体状况和生理周期都有所不同。如果您担心怀孕，建议采取以下措施：
1.咨询医生：如果您的月经周期不规律，或者您有其他怀孕的风险因素，建议咨询医生或妇科专家，了解更多关于避孕和怀孕的信息。
2.使用避孕方法：即使在安全期，也不能完全排除怀孕的风险。使用可靠的避孕方法，如避孕套、口服避孕药等，可以进一步降低怀孕的可能性。
3.注意身体变化：如果您在同房后出现月经推迟、恶心、呕吐、乳房胀痛等症状，可能是怀孕的迹象。此时建议进行验孕测试或咨询医生。
总之，月经停了两天后同房是否会怀孕是一个复杂的问题，无法简单地给出肯定或否定的答案。如果您对怀孕的风险感到担忧，建议咨询专业医生，以便做出明智的决策。同时，也要注意保护自己的身体健康，避免不必要的性行为带来的风险。