妊娠期患者使用抗菌药物的注意事项如下：
1.药物选择：应尽量选择对胎儿安全的抗菌药物，如青霉素类、头孢菌素类等。避免使用氨基糖苷类、四环素类、喹诺酮类等可能对胎儿有不良影响的药物。
2.用药时机：妊娠早期（前3个月）应尽量避免使用抗菌药物，尤其是致畸药物。如果病情需要，应在医生的指导下权衡利弊后使用。
3.用药剂量：应按照患者的体重、体表面积等因素调整用药剂量，避免药物过量导致胎儿毒性。
4.用药途径：尽量选择口服或肌内注射等途径，避免使用静脉输注等可能对胎儿有较大刺激的途径。
5.药物相互作用：应告知医生正在使用的其他药物，包括处方药、非处方药、中药等，避免药物相互作用导致不良后果。
6.定期产检：应按照医生的建议定期进行产前检查，密切关注胎儿的发育情况。
7.过敏反应：如果患者对某种抗菌药物过敏，应及时告知医生，避免使用该药物。
8.特殊情况：如果患者患有严重的感染性疾病，如败血症、肺炎等，需要使用抗菌药物治疗，应在医生的密切监护下使用，并及时调整药物剂量和治疗方案。
总之，妊娠期患者使用抗菌药物需要谨慎，应在医生的指导下使用，避免自行用药。同时，应注意个人卫生，保持良好的生活习惯，提高自身免疫力，有助于预防感染性疾病的发生。