发烧咽痛时可以根据具体情况选择药物，一般常用非甾体抗炎药等缓解症状。比如对乙酰氨基酚可以起到退热止痛的作用，大约能在30分钟 - 1小时左右起效来降低体温、缓解咽痛带来的疼痛。
对症药物选择
非甾体抗炎药：像布洛芬，它能通过抑制前列腺素合成，达到解热、镇痛、抗炎的效果，可用于缓解发烧咽痛症状。不过6个月以下婴儿不建议使用布洛芬。对乙酰氨基酚：也能有效退热止痛，成人及12岁以上儿童常用剂量下相对安全，但3个月以下婴儿需谨慎，必须在医生指导下使用。
病因相关用药
病毒感染导致：如果是病毒感染引起的发烧咽痛，一般没有特效抗病毒药物，主要还是以对症治疗为主。比如普通感冒病毒感染引发的情况，就依靠上述的退热止痛药物来缓解不适症状，同时要注意休息、多喝水。细菌感染导致：若是细菌感染引起，如链球菌感染导致的扁桃体炎出现发烧咽痛，可能需要使用抗生素，比如青霉素类抗生素（不过要注意有无青霉素过敏史），但抗生素的使用必须由医生根据病情判断后开具，不能自行随意使用。
儿童用药特别注意
儿童发烧咽痛：儿童用药需格外谨慎，2岁以下幼儿一般不推荐使用复方感冒制剂。可以选择适合儿童的对乙酰氨基酚混悬滴剂来退热，剂量要严格按照儿童体重计算，不能超量。如果是病毒感染，同样以对症处理为主，若怀疑细菌感染导致，一定要在医生指导下使用抗生素，比如儿童用的头孢类抗生素（需确认无过敏史）。孕妇发烧咽痛：孕妇出现发烧咽痛时，对乙酰氨基酚相对是较安全的选择，使用前需咨询医生，评估病情后再决定是否使用。而布洛芬在孕期尤其是孕晚期应避免使用，因为可能会对胎儿产生不良影响。