颅骨嗜酸性肉芽肿的治疗需根据病情等综合判断，一般可通过手术、放疗等方式治疗。
手术治疗情况
局限性病变：对于局限性的颅骨嗜酸性肉芽肿，手术切除是常用的治疗方法之一。如果病变比较局限，手术完整切除病灶往往能取得较好的效果。比如一些较小的、边界清楚的颅骨嗜酸性肉芽肿病灶，通过手术完整切除后，患者恢复情况通常较好。多发性病变：如果是多发性的颅骨嗜酸性肉芽肿，单纯手术切除可能不太适用，需要结合其他治疗方法。但对于部分局限性的病灶，手术仍可作为首要的干预手段来尽量清除病变组织。
放射治疗情况
适用于不宜手术者：对于一些不适合手术切除的患者，放射治疗是重要的治疗方式。一般来说，小剂量的放射治疗就可以起到较好的控制作用。例如，对于一些范围较广但无法完全手术切除的颅骨嗜酸性肉芽肿，采用局部小剂量放射治疗，能够抑制病变的发展，缓解相关症状。儿童患者需谨慎：儿童患者在进行放射治疗时需要特别谨慎，因为放射治疗可能会对儿童的生长发育产生一定影响，所以要严格掌握放射治疗的指征和剂量等，需由专业医生根据患儿具体情况来决定是否采用及如何实施放射治疗。
药物辅助治疗情况
糖皮质激素：在某些情况下，可能会使用糖皮质激素进行辅助治疗。比如对于病情较为严重或有炎症反应较明显的患者，短期使用糖皮质激素可以减轻炎症反应等。但糖皮质激素的使用需要严格遵循医嘱，因为长期或不恰当使用可能会带来一些副作用，像导致骨质疏松等问题。其他药物：目前针对颅骨嗜酸性肉芽肿的特异性药物相对较少，主要还是以手术、放疗等为主，药物辅助治疗多是根据患者的具体症状等进行对症支持等处理，一般是作为综合治疗的一部分来配合手术和放疗等手段来发挥作用。