吉兰-巴雷综合征的患者，大约90%以上患者的病情在4周内停止进展，多数经1-2个月的积极治疗后开始恢复，多数可以临床治愈。
一部分患者可能会出现病情逐渐加重，可以引起呼吸肌衰竭，可能会引起患者死亡。该病的治疗主要包括，急性期应用足量的B族维生素、维生素C、辅酶Q10，常用的B族维生素有维生素B1、维生素B6、维生素B12和甲钴胺等。
同时要给予患者足够的热量，易消化饮食，如果患者出现吞咽困难时，应及时下胃管，保留胃管，鼻饲饮食。如果患者出现呼吸肌麻痹史，应密切观察患者的呼吸，保持呼吸道通畅。
如果有分泌物过多时应尽早给予气管切开，必要时使用呼吸机辅助通气治疗，恢复期应及时给予康复治疗和针灸治疗，防止肢体挛缩和畸形。