治口腔溃疡并没有绝对最快的药，但可以通过局部用药来缓解症状，一般使用后1-3天可能会有改善。常见的治疗口腔溃疡的药物有以下几类：
局部用药类
含漱剂： 如氯己定含漱液，它能减少口腔细菌，抑制菌斑形成，有助于促进口腔溃疡愈合，一般每天含漱2-3次，每次10-15毫升。含片： 西地碘含片，可直接卤化细菌的体蛋白，杀菌抗感染，含服，一次1片，一日3-5次。
散剂类
冰硼散： 传统的治疗口腔溃疡的散剂，有清热解毒、消肿止痛的功效，用药时取少量吹敷患处，一日数次。但儿童使用时要注意避免过量误吸。锡类散： 同样具有解毒化腐的作用，外用，每次少许，吹敷患处，一日1-2次。
凝胶类
重组人表皮生长因子凝胶： 能促进皮肤与黏膜创面组织修复过程中的DNA、RNA和羟脯氨酸的合成，加速创面肉芽组织的生成和上皮细胞的增殖，从而缩短创面的愈合时间。用法是将凝胶直接涂于患处，一日4次。不过，对本品过敏者禁用。
贴剂类
醋酸地塞米松粘贴片： 具有抗炎、抗过敏作用，能减轻炎症反应，缓解疼痛。使用时将贴片贴于患处，一次1片，一日总量不超过3片，连用不得超过1周。但孕妇、哺乳期妇女以及对本品过敏者慎用。口腔溃疡患者在使用药物的同时，还应注意保持口腔清洁，早晚刷牙、饭后漱口；保证充足的睡眠，避免熬夜；饮食上要多吃富含维生素的蔬菜水果，避免吃辛辣、刺激性强的食物，这样有助于口腔溃疡更快地愈合。