儿童发烧后耳朵疼，可能是由以下原因引起：
1.咽鼓管炎：咽鼓管是连接鼻咽部和中耳腔的通道。儿童的咽鼓管较短、宽且平直，呈水平位，因此，当儿童患上呼吸道感染时，鼻咽部的炎症容易通过咽鼓管蔓延至中耳腔，引起中耳炎，导致耳朵疼痛。
2.大疱性鼓膜炎：大疱性鼓膜炎是一种鼓膜急性炎症，可由病毒或细菌感染引起。主要症状为耳部疼痛，通常在鼓膜起疱后疼痛可减轻。
3.外耳道炎：当儿童发烧时，抵抗力下降，容易导致外耳道炎。外耳道炎可引起耳部疼痛，尤其是在牵拉耳廓或按压耳屏时疼痛更为明显。
4.耳部耵聍：如果儿童的耳朵内耵聍较多，在发烧时耵聍可能会因肿胀而刺激外耳道皮肤，引起疼痛。
5.其他：耳部的其他疾病，如耳部外伤、耳部肿瘤等，也可能导致儿童在发烧后出现耳朵疼痛。
如果儿童发烧后出现耳朵疼痛，建议及时就医，进行详细的耳部检查和相关的实验室检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，家长应注意保持儿童耳部的清洁，避免水进入耳道，避免给儿童挖耳，以免加重耳部疼痛。