卵巢囊肿有分隔和无分隔主要与囊肿的性质有关。一般来说，卵巢囊肿无分隔的多考虑为单纯性囊肿，而有分隔的囊肿可能提示多种情况。通常超声检查可发现卵巢囊肿有无分隔。
从性质看差异
无分隔卵巢囊肿：多为单纯良性
无分隔的卵巢囊肿相对单纯，大多考虑是良性的功能性囊肿，比如卵泡囊肿。这种囊肿通常直径一般在5厘米以内，很多时候会在月经周期变化中自然消失，比如在月经结束后再次复查超声，部分无分隔的小囊肿可能就不见了。
有分隔卵巢囊肿：需多方面考虑
有分隔的卵巢囊肿情况相对复杂些。一方面可能是良性病变，像浆液性或黏液性囊腺瘤等也可能有分隔；但另一方面也不能排除恶性的可能，比如卵巢癌等也可能表现为有分隔的囊肿。而且有分隔的囊肿直径往往相对更大，比如有的可能超过5厘米。
从超声表现分析
无分隔卵巢囊肿超声特点
超声下无分隔的卵巢囊肿表现为边界清晰的单腔囊性回声，内部透声好，囊壁比较薄且均匀。
有分隔卵巢囊肿超声特点
超声下有分隔的卵巢囊肿可见囊内有线条状分隔光带，分隔可能厚薄不均，囊肿的边界相对来说可能没有纯无分隔囊肿那么清晰规整。
从临床处理角度
无分隔卵巢囊肿处理
对于直径小于5厘米的无分隔卵巢囊肿，可定期复查超声，一般间隔1 - 3个月复查一次，观察囊肿变化。如果是在排卵期发现的小的无分隔囊肿，有可能是生理性的，更可以先观察。
有分隔卵巢囊肿处理
对于有分隔的卵巢囊肿，尤其是直径大于5厘米或者有恶变倾向可疑表现的，往往需要进一步检查，比如做肿瘤标志物检查（像CA125等），必要时可能需要进行手术探查，通过手术切除囊肿并做病理检查来明确其性质，从而进行针对性治疗。