脑脊液的产生部位是侧脑室的脉络丛，脑脊液的产生之后主要存在于脑室和蛛网膜下腔。正常的脑脊液是一种无色透明的液体，当发生病变时，比如颅脑出血时脑脊液可以是淡红色的，如果是感染性疾病脑脊液会变黄，严重的时候会产生沉积。
对于脑脊液正常压力是80-180mmH2O，如果压力过高或者是压力过低时，病人都会有相应的症状。对于脑脊液临床上大多采用腰穿来提取脑脊液，做一些常规以及生化的检查，有助于查明一些中枢神经系统的感染性疾病，或者怀疑有蛛网膜下腔出血破入脑室等，都可以进行腰穿的检查。
同时，对于颅内的免疫性的脑炎也有一定的确诊意义。