小腿肌肉酸痛可能由多种原因引起。比如运动过量是常见因素，若长时间不运动，突然进行高强度运动，像跑步、爬山等，运动后24 - 48小时内可能出现小腿肌肉酸痛，这是因为运动时肌肉产生大量乳酸堆积所致。
运动相关因素导致
运动强度过大：当进行超出身体适应范围的运动时，例如一次性快跑超过1000米，小腿肌肉在短时间内承受过大负荷，就容易引发酸痛。运动中肌肉不断收缩，能量消耗快，同时代谢产生的乳酸等酸性物质不能及时代谢排出，就会导致酸痛。运动前准备不足：运动前没有进行充分的热身活动，小腿肌肉没有得到良好的激活，直接进入高强度运动状态，肌肉的伸展性和弹性较差，在运动过程中容易受伤，进而出现酸痛。比如突然开始剧烈跳绳前不热身，小腿肌肉很容易酸痛。
疾病因素导致
腰椎间盘突出症：当腰椎间盘发生退变、纤维环部分或全部断裂，髓核突出刺激或压迫神经根时，可能会引起小腿肌肉酸痛。这种情况常见于长期从事重体力劳动或久坐久站的人群，大约有10% - 15%的腰椎间盘突出症患者会出现下肢放射性疼痛，其中就包括小腿肌肉酸痛。下肢血管病变：如下肢静脉曲张，由于静脉回流不畅，小腿肌肉长时间处于缺血缺氧状态，也会出现酸痛。据统计，成年人中约有10% - 15%患有不同程度的下肢静脉曲张，患病后小腿往往会有沉重、酸痛感，尤其是在长时间站立后加重。
其他因素导致
寒冷刺激：小腿肌肉受到寒冷刺激时，血管收缩，血液循环不畅，也会引起酸痛。比如在寒冷的环境中长时间行走，没有做好保暖措施，小腿肌肉就容易因寒冷而出现酸痛症状。营养缺乏：缺乏维生素D或钙时，也可能导致小腿肌肉酸痛。维生素D有助于钙的吸收，当人体缺乏维生素D时，钙的吸收利用受到影响，肌肉兴奋性增高，就容易出现痉挛、酸痛等情况。一般来说，成年人每天需要摄入400 - 800国际单位的维生素D来维持身体正常需求。