卡氏肺孢子虫肺炎的治疗方法主要是药物治疗，首选复方磺胺甲噁唑，也可以使用喷他脒、戊烷脒等药物。
复方磺胺甲噁唑是卡氏肺孢子虫肺炎的首选药物，对卡氏肺孢子虫有较强的抑制作用。使用时应注意药物的剂量和疗程，避免药物不良反应的发生。
喷他脒是一种广谱抗寄生虫药物，对卡氏肺孢子虫也有较好的治疗效果。但喷他脒的不良反应较多，如心脏毒性、骨髓抑制等，使用时需要密切监测患者的生命体征和血常规等指标。
戊烷脒也是一种有效的抗寄生虫药物，但目前临床应用较少。
除了药物治疗外，对于重症患者，还需要给予支持治疗，如吸氧、补液、营养支持等，以维持患者的生命体征和内环境稳定。
此外，对于免疫功能缺陷的患者，如艾滋病患者，卡氏肺孢子虫肺炎的治疗难度较大，需要综合考虑患者的免疫状态和其他合并症，制定个体化的治疗方案。
总之，卡氏肺孢子虫肺炎的治疗需要根据患者的具体情况进行选择，早期诊断和治疗对于提高患者的生存率至关重要。