头皮一阵一阵的刺痛多见于神经性疼痛，临床上常见的有三叉神经痛、枕大神经痛、头皮带状疱疹。三叉神经痛疼痛部位位于一侧面部，疼痛持续时间短、程度重，呈针刺样刀割样疼痛，长时间反复疼痛者可伴有焦虑、抑郁等精神症状，此病多由于三叉神经颅内段受血管或者肿瘤压迫所致。
枕大神经痛的疼痛部位位于后枕部及后颈部，主要由于枕大神经出口处的炎症刺激导致。带状疱疹也可以引起头皮一阵一阵的刺痛，多在抵抗力低下的时候发病，除了疼痛之外还可见疱疹成对出现，早期疱液比较清亮，随着时间的延长会出现混浊，最后结痂脱落，可伴有发烧、四肢酸痛。
除此之外，急性脑血管病、颅内占位性病变也可出现头颅刺痛。出现疼痛的症状不建议盲目口服止疼药物，以免掩盖症状贻误治疗。