晚上遗精后尿道疼痛可能是以下原因导致的：
1.精囊炎：精囊炎是男性生殖系统的常见感染性疾病，常与前列腺炎同时发生。精囊位于前列腺后上方，是一对长椭圆形的囊状器官。由于精囊腺的分泌液是精液的主要成分之一，当精囊发生炎症时，会导致精液中带血，从而引起尿道疼痛。此外，精囊炎还可能导致尿频、尿急、尿痛等症状。治疗精囊炎通常采用抗生素治疗，如头孢菌素、左氧氟沙星等。
2.前列腺炎：前列腺炎是男性常见的疾病之一，可分为急性前列腺炎和慢性前列腺炎。前列腺炎可导致尿道疼痛、尿频、尿急、尿痛等症状。治疗前列腺炎的方法包括药物治疗、物理治疗和手术治疗等。药物治疗通常采用抗生素、α-受体阻滞剂、非甾体抗炎镇痛药等。
3.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、病毒、支原体等感染引起。尿道炎可导致尿道疼痛、尿频、尿急、尿痛等症状。治疗尿道炎的方法包括药物治疗、物理治疗等。药物治疗通常采用抗生素、抗病毒药物、抗真菌药物等。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果出现晚上遗精后尿道疼痛的症状，建议及时就医，以便明确病因，并采取相应的治疗措施。