卵巢囊肿是否会自己消失，主要取决于囊肿的性质和病因。以下两种情况下，卵巢囊肿可能会自行消失：
1.功能性卵巢囊肿：
滤泡囊肿和黄体囊肿：这是卵巢的正常生理变化，通常在月经周期中出现。滤泡囊肿是由于卵泡发育成熟但未破裂排卵，导致卵泡液潴留形成的；黄体囊肿则是由于排卵后黄体形成过程中，黄体血肿液化形成的。这类囊肿一般较小，直径通常在3-5厘米之间，可在月经后自行消失。
黄素化未破裂卵泡综合征：这是一种无排卵的异常情况，卵泡成熟后未破裂，黄素化形成囊肿。这种囊肿也可能在几个月内自行消退。
2.子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）：
较小的囊肿：直径小于4厘米的巧克力囊肿，可能在使用避孕药、孕激素等药物治疗后，囊肿缩小甚至消失。
绝经后：卵巢功能衰退，雌激素水平下降，子宫内膜异位症病灶会逐渐萎缩，囊肿也可能随之缩小或消失。
需要注意的是，虽然有些卵巢囊肿可能会自行消失，但在发现卵巢囊肿后，仍需密切观察其变化。以下情况需要及时就医：
1.囊肿持续存在：经过一段时间的观察，囊肿没有消失或反而增大，应进一步检查，以排除其他潜在的疾病。
2.出现症状：如腹痛、腹胀、性交痛、月经异常等，可能是囊肿引起的不适，需要及时就医。
3.怀疑恶变：卵巢囊肿有一定的恶变风险，尤其是年龄较大、囊肿较大、生长迅速或有实性成分的囊肿。医生可能会建议进行进一步的检查，如肿瘤标志物检测、超声造影、磁共振成像（MRI）等，以评估囊肿的性质。
对于卵巢囊肿的处理，应根据具体情况综合考虑。医生会根据囊肿的大小、性质、症状、患者的年龄和生育需求等因素，制定个性化的治疗方案。常见的治疗方法包括定期复查、药物治疗、手术治疗等。
总之，大多数功能性卵巢囊肿可能会自行消失，但对于持续存在或有症状的囊肿，以及怀疑恶变的囊肿，应及时就医，以便早期诊断和治疗。同时，定期进行妇科检查也是发现和监测卵巢囊肿的重要措施。