喉咙侧边疼可能是扁桃体炎、扁桃体周围脓肿、咽炎、会厌炎、茎突过长等原因所致，可以通过药物、手术等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.扁桃体炎：多由乙型溶血性链球菌、肺炎链球菌等感染引起，可导致扁桃体红肿、疼痛，严重时可出现吞咽困难、发热等症状。
2.扁桃体周围脓肿：多由扁桃体炎进一步发展所致，表现为扁桃体区剧烈疼痛，吞咽时加重，还可伴有张口困难、口臭等症状。
3.咽炎：可由病毒、细菌感染引起，也可因粉尘、烟雾等刺激导致，主要表现为咽部干燥、灼热、疼痛，吞咽时疼痛加重。
4.会厌炎：多由感染、过敏等原因引起，可导致会厌肿胀，从而引起喉部疼痛、吞咽困难、呼吸困难等症状。
5.茎突过长：是一种先天发育异常，茎突过长可刺激咽部，引起咽痛。
患者在治疗期间需要注意休息，多喝水，饮食宜清淡，避免食用辛辣、刺激性食物。同时，应及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。