乙肝疫苗通常是三针接种程序更好。目前临床上广泛使用的乙肝疫苗接种方案一般是0、1、6个月各接种一针，全程免疫程序需要接种三针。比如新生儿出生后24小时内接种第一针乙肝疫苗，然后1个月时接种第二针，6个月时接种第三针，经过这样的三针接种后，约90%以上的接种者可产生保护性抗体。
接种程序的免疫效果
抗体产生情况：接种第一针乙肝疫苗后，只有30%左右的人产生表面抗体，而且抗体效果不稳定；接种第二针后，约80%的人产生抗体；接种第三针后，抗体阳性率可达到90%以上，并且抗体效果较为持久。免疫记忆形成：三针接种能更好地激发机体的免疫记忆，使得免疫系统在接触乙肝病毒时能快速做出有效的免疫应答，长期维持对乙肝病毒的免疫力。
不同接种程序的适用场景
新生儿接种：新生儿必须按照0、1、6个月的程序接种三针乙肝疫苗，这是因为新生儿自身免疫系统尚未发育完善，通过三针接种能最大程度刺激免疫系统产生足够的保护性抗体来抵御乙肝病毒感染。成人补种情况：如果成人之前没有全程接种过乙肝疫苗或者抗体水平较低，一般也需要按照0、1、6个月的程序补种三针。比如既往只接种过一针乙肝疫苗的成人，需要重新按照三针程序接种才能保证产生足够的保护性抗体。
单针接种的局限性
保护效果不足：目前没有证据表明单针接种乙肝疫苗能达到像三针接种那样良好且持久的保护效果。单针接种后产生有效保护性抗体的比例远低于三针接种，而且抗体持续时间相对较短。无法形成长效免疫：单针接种后机体产生的免疫反应强度和持续时间都不足以让免疫系统长时间对乙肝病毒保持警惕，不能像三针接种那样形成较为长效的免疫防护，在接触乙肝病毒时更容易感染。