阴茎上面长小疙瘩可能是尖锐湿疣、珍珠状阴茎丘疹、皮脂腺异位症、传染性软疣、阴茎湿疹等原因引起的，具体分析如下：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。表现为阴茎上面出现单个或多个小而柔软的淡红色丘疹，逐渐增大、增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。可以通过冷冻、激光、电灼等物理治疗，或外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物治疗。治疗期间应避免性生活，注意局部清洁，避免搔抓、摩擦疣体，以防感染扩散。
2.珍珠状阴茎丘疹：病因尚未明确，可能与生理发育变异、包皮过长、局部刺激等有关。表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现的珍珠状、半透明丘疹，可为白色、黄色或红色，丘疹互不融合，无压痛、无破溃。一般不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光、冷冻等物理方法去除丘疹。
3.皮脂腺异位症：病因不明，可能与内分泌因素、局部刺激或创伤有关。表现为阴茎上面出现针头大小的淡黄色或白色丘疹，散在或密集，可无任何自觉症状。一般不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光、电灼等物理方法去除丘疹。
4.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。表现为阴茎上面出现半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。可以通过刮除、挤出疣体，或使用冷冻、激光等方法治疗。治疗期间应避免搔抓疣体，以防自身接种传播。
5.阴茎湿疹：病因复杂，可能与过敏、感染、局部刺激等有关。表现为阴茎上面出现红斑、丘疹、水疱，可伴有瘙痒、疼痛。可以通过外用糖皮质激素乳膏、氧化锌软膏等药物治疗，若有感染，可外用抗生素乳膏。治疗期间应避免食用辛辣、刺激性食物，避免热水烫洗、搔抓患处。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持局部清洁、干燥，避免搔抓、摩擦患处，以免加重病情。同时，应避免不洁性生活，以防交叉感染。若阴茎上面的小疙瘩持续不消失或伴有其他症状，应及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。