切除扁桃体可能带来一些危害，比如术后出血风险，一般来说儿童扁桃体切除术后出血发生率约为1%~2%。另外，切除扁桃体还可能影响局部免疫功能，因为扁桃体是人体免疫系统的一部分，在儿童时期尤其重要，切除后局部抵御病菌的能力可能会有一定程度下降，不过这种影响通常随着年龄增长会逐渐被其他免疫器官代偿，但在儿童早期仍需注意防护感染。
免疫功能方面的潜在影响
短期免疫影响： 扁桃体在儿童时期是重要的免疫器官，能抵御部分病菌入侵。切除后，短期内上呼吸道的局部免疫防御可能会有波动。比如在术后1~2周内，孩子可能相对更容易出现上呼吸道轻度感染的情况，但一般不会有严重的全身性免疫功能大幅下降。长期代偿情况： 随着孩子年龄增长，身体的其他免疫器官会逐渐代偿扁桃体的部分功能。比如脾脏、淋巴结等免疫器官会加强工作，但这个代偿过程不是完全完美的，在一些特定情况下，比如孩子免疫力本身较弱时，相比没有切除扁桃体的孩子，可能还是稍容易有呼吸道相关的轻微感染，但多数孩子经过成长后能较好适应。
术后恢复相关问题
出血风险： 虽然现在手术技术不断进步，但术后仍有出血可能。一般术后24小时内是出血高发期，少量渗血比较常见，表现为口咽部有少量血丝，但如果是较大量出血，可能会出现呕血、咽部疼痛明显加重等情况，需要及时处理。另外，术后1~2周也可能有迟发性出血，不过发生率相对较低。疼痛与恢复时间： 术后孩子会有不同程度的疼痛，一般疼痛会持续1周左右。在恢复期间，孩子的饮食需要注意，前几天可能需要吃温凉的流食，像牛奶、藕粉等，之后逐渐过渡到半流食、软食，完全恢复正常饮食大概需要2~3周时间。而且在恢复过程中要注意口腔卫生，每天需要用淡盐水漱口等，防止伤口感染影响恢复。
对吞咽功能的可能影响
短期吞咽不适： 术后孩子吞咽时可能会有疼痛，从而出现吞咽不畅的情况，表现为吃饭时不敢大口吞咽，这种情况随着伤口逐渐愈合会慢慢改善。一般术后10天左右，吞咽不适会明显减轻。长期吞咽功能： 大部分孩子在扁桃体切除术后吞咽功能能恢复正常，但少数孩子可能会因为术后伤口瘢痕形成等原因，出现轻度吞咽功能异常，比如偶尔感觉咽部有异物感或者吞咽时稍有不畅，但这种情况非常少见，而且通过后续的恢复和适应，多数也能恢复到正常状态。