怀孕42天做B超未见孕囊，可能是以下原因：
1.受孕时间晚：受精卵着床时间较晚，孕囊还没有形成或太小，B超无法检测到。
2.宫外孕：孕囊在子宫外着床，如输卵管、卵巢等部位，B超也无法看到孕囊。
3.胎停育：孕囊内胎芽或胎儿形态不完整，无胎心搏动，B超检查时看不到孕囊。
4.其他：孕妇本身存在子宫畸形、子宫肌瘤等疾病，也会影响孕囊的发育和位置。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合临床症状、HCG水平等综合判断。如果怀孕42天做B超未见孕囊，建议及时就医，医生会根据具体情况进行进一步的检查和诊断，并制定相应的治疗方案。在等待检查结果期间，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，如有阴道流血、腹痛等异常情况，应立即就医。