丙肝和乙肝都是由病毒引起的肝脏疾病，但它们有诸多区别。丙肝是由丙型肝炎病毒（HCV）引起的，乙肝则是由乙型肝炎病毒（HBV）引起的。
病原体方面
丙肝病毒：丙肝病毒属于黄病毒科丙型肝炎病毒属，它的基因变异性比较高。乙肝病毒：乙肝病毒属于嗜肝DNA病毒科正嗜肝DNA病毒属，它有三种主要抗原抗体系统，即乙肝表面抗原/抗体（HBsAg/抗HBs）、乙肝e抗原/抗体（HBeAg/抗HBe）和乙肝核心抗原/抗体（HBcAg/抗HBc）。
传播途径方面
丙肝传播途径：主要通过血液传播，比如输入被丙肝病毒污染的血液或血制品；也可通过破损的皮肤黏膜传播，像共用注射器吸毒、不洁的纹身、穿耳洞等；母婴传播虽有，但相对乙肝来说几率较低。乙肝传播途径：母婴传播是乙肝重要的传播途径，母亲在分娩时可将乙肝病毒传给婴儿；血液传播也是重要途径，如输入被乙肝病毒污染的血液及血制品，使用未经严格消毒的医疗器械等；性传播也是乙肝的传播方式之一，与乙肝患者发生无防护的性接触，有可能感染乙肝病毒。
感染后的表现方面
丙肝感染表现：部分丙肝感染者可无明显症状，容易被忽视。约有50% - 85%的急性丙肝感染者会发展为慢性丙肝，进而可能逐渐出现乏力、食欲减退、右上腹不适等症状，长期慢性感染可能导致肝硬化、肝癌等严重后果。乙肝感染表现：急性乙肝感染后，部分人会出现乏力、食欲减退、恶心、呕吐、黄疸（皮肤巩膜黄染）等症状；也有部分人感染乙肝病毒后成为无症状携带者；慢性乙肝患者可能有乏力、腹胀、肝区不适等表现，同样可能进展为肝硬化、肝癌。
诊断方法方面
丙肝诊断：主要通过检测丙肝病毒RNA来判断是否感染丙肝病毒，还会检测丙肝抗体，丙肝抗体阳性提示曾感染过丙肝病毒，但要确诊需结合丙肝病毒RNA。乙肝诊断：通过检测乙肝五项（乙肝两对半）来判断乙肝感染状态，同时检测肝功能、乙肝病毒DNA等，以评估病情严重程度和病毒复制情况，比如乙肝病毒DNA阳性提示病毒复制活跃，传染性强。