乙脑疫苗是预防流行性乙型脑炎的有效手段，但部分人接种后可能出现不良反应。一般来说，乙脑疫苗的不良反应发生率较低，但仍需了解相关情况。
局部不良反应
注射部位红肿：接种乙脑疫苗后，少数人会出现注射部位红肿，一般红肿范围较小，直径多在2~5厘米左右，通常1~2天内可自行消退。注射部位疼痛：部分接种者会感到注射部位有轻微疼痛，一般不需要特殊处理，1~2天可缓解。
全身不良反应
发热：接种乙脑疫苗后，少数人可能出现发热，一般为低热，体温多在37.5~38.5℃之间，这种发热通常会在1~2天内自行消退。不过也有少数人可能出现中度发热，体温在38.5~39℃之间，但一般也会在较短时间内恢复正常。轻微头痛、乏力：有些接种者会出现轻微的头痛、乏力症状，一般程度较轻，不影响日常生活，多在1~3天内逐渐消失。
罕见不良反应
过敏反应：虽然很少见，但也有个别人接种乙脑疫苗后可能出现过敏反应，如皮肤出现皮疹、瘙痒，严重的可能出现呼吸困难、面色苍白、血压下降等过敏性休克表现。如果出现过敏反应，需立即就医进行相应治疗。惊厥：极个别儿童接种乙脑疫苗后可能发生惊厥，但这种情况非常罕见，一般与儿童个体的特殊体质有关，一旦发生需及时送医处理。在接种乙脑疫苗后，要在接种场所观察30分钟左右，以便出现不良反应时能及时处理。如果接种后出现较严重或持续不缓解的不良反应，应及时就医，并向医生详细告知接种情况。