包皮炎的治疗药物需根据病因选择，一般来说，细菌感染引起的包皮炎可选用抗生素类药物，如莫匹罗星软膏等，通常用药后数天内症状会有所改善。真菌感染导致的包皮炎可使用抗真菌药物，像克霉唑乳膏等，规范用药1 - 2周左右可能见效。
细菌感染性包皮炎用药
莫匹罗星软膏： 它是一种局部外用的抗生素，对革兰阳性球菌有很强的抗菌活性，能抑制细菌蛋白质的合成，从而起到杀菌消炎的作用，可用于治疗细菌感染引起的包皮炎，能帮助减轻包皮的红肿、疼痛等症状。夫西地酸乳膏： 主要针对葡萄球菌等引起的感染，通过抑制细菌的蛋白质合成来发挥抗菌功效，对于细菌感染导致的包皮炎有较好的治疗效果，使用时将药膏适量涂抹在患处。
真菌感染性包皮炎用药
克霉唑乳膏： 属于抗真菌药物，能抑制真菌细胞膜的合成，影响其代谢过程，对白色念珠菌等真菌有较好的抑制作用，适用于真菌感染引发的包皮炎，一般每天涂抹2 - 3次，坚持用药可缓解症状。酮康唑乳膏： 同样是抗真菌药，通过干扰真菌细胞色素P450的活性，影响真菌细胞膜的合成，进而发挥抗真菌作用，用于治疗真菌感染导致的包皮炎，使用时要注意保持局部清洁干燥。
非感染性包皮炎辅助用药
糖皮质激素类药膏（短期使用）： 像氢化可的松乳膏等，对于一些因过敏等非感染因素引起的包皮炎，在医生指导下短期使用可以减轻炎症反应，缓解红肿、瘙痒等症状，但不能长期大量使用，以免引起不良反应。不过这类药物使用需谨慎，要严格遵循医嘱。中药外洗制剂： 比如黄柏洗液等，有些中药外洗制剂具有清热解毒、消肿止痛的作用，可辅助治疗包皮炎，使用时按照说明书将药液稀释后进行外洗，能在一定程度上改善包皮炎的症状，但它不能替代主要的针对性治疗药物。