根尖囊肿手术过程中通常会使用局部麻醉，因此在手术过程中患者不会感到疼痛。但在手术前需要进行局部注射麻醉剂，这个过程可能会有一些疼痛和不适。
在手术过程中，患者会处于清醒状态，但由于局部麻醉的作用，手术区域会被麻木，不会感到疼痛。医生会在口腔内进行小切口，然后将囊肿和周围的组织切除。在手术过程中，患者可能会感到一些压力和牵拉感，但这些感觉通常是可以忍受的。
手术后，患者可能会感到一些疼痛和肿胀，这是正常的反应。医生会根据患者的情况给予相应的止痛药物和冷敷治疗，以缓解疼痛和肿胀。患者需要注意口腔卫生，避免食用辛辣、刺激性食物，以促进伤口愈合。
需要注意的是，对于一些特殊人群，如儿童、孕妇、高血压患者等，手术前需要进行详细的评估和准备，以确保手术的安全性和有效性。此外，手术后的恢复情况也因人而异，患者需要按照医生的建议进行护理和复诊，以确保伤口愈合良好。
总之，根尖囊肿手术过程中患者不会感到疼痛，但在手术前和手术后可能会有一些不适和疼痛。患者可以通过与医生沟通、放松心情等方式缓解紧张情绪，积极配合医生的治疗。