慢性前列腺炎治疗药物需根据具体类型选择，一般抗菌药物是常用治疗药物之一，比如对于细菌性慢性前列腺炎，常用的有左氧氟沙星等喹诺酮类药物，疗程通常需要4~6周左右。
抗菌药物的应用
喹诺酮类药物： 像左氧氟沙星，它能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用，对慢性细菌性前列腺炎有较好疗效，但18岁以下患者应避免使用，因为可能影响软骨发育。大环内酯类药物： 例如红霉素，可穿透前列腺包膜，在前列腺内达到一定药物浓度，对支原体、衣原体感染引起的慢性前列腺炎有一定效果，不过可能会有胃肠道不适等副作用。
α-受体阻滞剂的作用
缓解排尿症状： α-受体阻滞剂能松弛前列腺和膀胱颈部平滑肌，减轻尿道阻力，改善排尿困难等症状。常用的有坦索罗辛，一般用药后数天到几周内就能看到排尿症状改善，它对心血管系统影响较小，但部分人可能会出现头晕、体位性低血压等情况，所以服药后不要突然站立。
非甾体抗炎镇痛药的使用
减轻炎症与疼痛： 非甾体抗炎镇痛药可以缓解慢性前列腺炎带来的疼痛和炎症反应。比如布洛芬，能抑制前列腺素合成，从而减轻疼痛和炎症，但有消化道溃疡病史的患者要慎用，因为可能会加重溃疡病情，用药期间要注意观察是否有胃痛、黑便等情况。
植物制剂的辅助治疗
改善症状： 一些植物制剂也可用于慢性前列腺炎的辅助治疗，像普适泰，它可以抑制炎症介质的释放，减轻前列腺组织水肿，改善尿频、尿急、尿痛等症状，副作用相对较少，但起效可能相对较慢，需要长期服用才能看到较好效果。