小孩低烧不退可能由多种原因引起。一般来说，持续低烧可能是感染性因素或非感染性因素导致。感染性因素中，病毒感染较为常见，比如EB病毒感染可能会让小孩持续低热数周；细菌感染如结核杆菌感染也会引发长期低烧，像肺结核就可能导致小孩反复低热、盗汗、乏力等。
感染性因素：
病毒感染： 除了EB病毒，像巨细胞病毒感染也可能引起小孩低烧不退。病毒在体内持续复制，会刺激免疫系统，导致体温调节中枢功能紊乱，从而出现长时间低热情况。一般病毒感染引起的低烧，可能会持续1 - 2周左右，但也有个体差异。细菌感染： 除了结核杆菌，布鲁氏菌感染也可能导致小孩低烧。布鲁氏菌侵入人体后，会在体内引起免疫反应，使得小孩体温长时间维持在低热水平，可能持续数周甚至数月。
非感染性因素：
自身免疫性疾病： 比如幼年特发性关节炎，这是儿童时期常见的自身免疫性疾病，会出现长期低热的症状，同时还可能有关节肿胀、疼痛、畸形等表现。另外，系统性红斑狼疮也可能累及儿童，导致低烧不退，还可能伴有面部红斑、口腔溃疡等症状。恶性肿瘤： 像白血病，早期可能会有低热表现，同时还可能伴有贫血、出血、肝脾淋巴结肿大等症状。肿瘤细胞释放的一些物质会影响体温调节，导致小孩持续低烧。
其他因素：
环境因素： 如果小孩穿着过厚、室内温度过高，也可能出现体温轻度升高，类似低烧不退的情况。但这种情况通过调整环境温度和衣物后，体温通常能恢复正常。比如室内温度过高时，将温度调节到22 - 25℃左右，减少小孩衣物，体温往往能下降。代谢性疾病： 如甲状腺功能亢进，虽然儿童时期较少见，但也有发生可能。甲状腺素分泌过多，会加快机体代谢，产热增加，导致小孩出现低热、多汗、烦躁等症状。