行房时肚子疼可能是盆腔炎、子宫内膜异位症、宫颈炎、精液过敏等原因所致，可以通过B超、血常规、腹腔镜等方式进行检查，建议及时就医。具体分析如下：
1.盆腔炎：女性上生殖道及其周围组织的炎症，包括子宫内膜炎、输卵管炎、输卵管卵巢脓肿和盆腔腹膜炎。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，最常见的是输卵管炎、输卵管卵巢炎。多发生在性活跃期、有月经的妇女，初潮前、绝经后或未婚者很少发生盆腔炎。若未能得到及时正确的治疗，可能会导致炎症在患者身体上造成许多不良影响，行房时的刺激可能引发盆腔炎性疾病的急性发作，出现肚子疼的症状。
2.子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的其他部位时，称为子宫内膜异位症。内异症的主要病理变化为异位内膜周期性出血及其周围组织纤维化，形成异位结节，痛经、慢性盆腔痛、性交痛、月经异常和不孕是其主要症状。在行房时，由于动作的刺激可能导致异位内膜的出血，从而引起肚子疼。
3.宫颈炎：子宫颈阴道部炎症，若未能及时治疗，可能会蔓延至子宫周围组织，甚至上行感染至盆腔，从而导致行房时肚子疼。
4.精液过敏：是一种特殊的免疫反应，由于精液中含有多种抗原物质，这些抗原物质可以刺激女性的免疫系统，导致过敏反应的发生。在行房时，精液进入女性体内，可能会引起过敏反应，导致肚子疼、阴道瘙痒、呼吸困难等症状。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，可适当食用富含维生素、蛋白质等营养物质的食物，避免食用辛辣、刺激性食物。