长期喝咖啡可能带来一些坏处。一般来说，每天摄入超过400毫克咖啡因（大约4杯普通咖啡）可能会产生不良影响。
影响睡眠方面
夜间易失眠：咖啡因是一种中枢神经系统兴奋剂，它会阻断腺苷受体，让人保持清醒状态。如果长期在较晚时间喝咖啡，比如下午4点后还喝，可能会导致入睡困难，有的人甚至会在床上翻来覆去半小时以上都无法入眠，影响睡眠质量。睡眠时长受影响：长期受咖啡因干扰睡眠的人，整体睡眠时间可能会减少。正常成年人需要7 - 9小时睡眠来维持身体正常机能，而长期喝咖啡可能使睡眠时间缩短到6小时以下，进而影响第二天的精神状态。
对肠胃的刺激方面
刺激胃酸分泌：咖啡中的成分会促进胃酸大量分泌，长期如此可能引发胃部不适。比如有研究发现，每天都喝咖啡的人，约有20%会出现胃酸反流现象，感觉胸口有灼热感，尤其是空腹喝咖啡时，这种刺激更明显。加重肠胃疾病风险：对于本身就有胃溃疡或者胃炎的人，长期喝咖啡会让病情加重。因为胃酸过多会损伤胃黏膜，使胃溃疡面更容易受到刺激，导致疼痛发作频率增加，原本稳定的胃炎也可能出现复发情况。
对心血管的影响方面
短期升高血压：一次性大量喝咖啡后，人体血压会有短时间的升高，收缩压可能会上升10 - 15毫米汞柱。长期频繁这样，会让血压处于相对较高的水平，增加高血压的发病风险。有数据显示，长期每天喝咖啡超过4杯的人群，患高血压的概率比不喝咖啡人群高30%左右。影响心率：部分人长期喝咖啡后，心率会有所加快。正常心率在60 - 100次/分钟，长期喝咖啡可能使静息心率维持在80次/分钟以上，对于本身就有心脏基础疾病的人，比如冠心病患者，可能会加重心脏负担，诱发心律失常等问题。